43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3047 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  66.97 
 
 		 240 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  41.89 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  38.36 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  37.25 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  35.98 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  35.91 
 
 		 260 aa  134  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  37.45 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  36.65 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  32.92 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  37.44 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  34.42 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  35.62 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  31.56 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  32.27 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  32.44 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  35.86 
 
 		 453 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  29.33 
 
 		 455 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  29.6 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  31.44 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  31.19 
 
 		 1140 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  29.22 
 
 		 1145 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  24.66 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  24.17 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  26.99 
 
 		 453 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  25.55 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  29.22 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 		 451 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  22.98 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  22.55 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  26.36 
 
 		 501 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  24.64 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  24.77 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  23.26 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  23.56 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  26.63 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  22.71 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  23.11 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.75 
 
 		 1505 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  23.87 
 
 		 308 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  24.1 
 
 		 515 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  24.66 
 
 		 281 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>