62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4651 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  47.12 
 
 
234 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  47.87 
 
 
261 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  39.45 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  42.25 
 
 
237 aa  164  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  43.87 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  40.38 
 
 
241 aa  157  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  40.94 
 
 
247 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  40.69 
 
 
230 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  37.39 
 
 
239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  38.1 
 
 
222 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  41.63 
 
 
440 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  39.89 
 
 
272 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  36.41 
 
 
452 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  38.25 
 
 
453 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  39.81 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  35.41 
 
 
239 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  37.04 
 
 
455 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  34.1 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  32.44 
 
 
242 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  33.19 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  37.35 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  29.96 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  30.52 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  29.44 
 
 
515 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.05 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  29.39 
 
 
1140 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  27.1 
 
 
501 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  31.85 
 
 
1145 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  28.31 
 
 
198 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.25 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  27 
 
 
209 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  27.54 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  28.83 
 
 
326 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  25.81 
 
 
255 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  24.67 
 
 
215 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  27.97 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.88 
 
 
1444 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  27.76 
 
 
268 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  26.18 
 
 
247 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.17 
 
 
1505 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  23.87 
 
 
558 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  23.18 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  24.46 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.95 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  27.66 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  24.18 
 
 
298 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  27.37 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  24.12 
 
 
255 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  27.19 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  28.48 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  25.59 
 
 
451 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  25.27 
 
 
304 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  26.56 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  21.4 
 
 
453 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>