71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3566 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  49.49 
 
 
241 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  43.78 
 
 
237 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  46.15 
 
 
234 aa  185  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  44.12 
 
 
261 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  37.45 
 
 
247 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  38.6 
 
 
230 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  40.27 
 
 
453 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  36.2 
 
 
239 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  34.5 
 
 
239 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  35.21 
 
 
260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  38.1 
 
 
226 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  39.74 
 
 
452 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  35.4 
 
 
440 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  37.84 
 
 
455 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  36.87 
 
 
238 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  40.64 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  33.05 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  35.62 
 
 
242 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  34.7 
 
 
240 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  30.66 
 
 
1140 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.77 
 
 
451 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
1145 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  30.33 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  30.77 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  26.47 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  28.16 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  30.43 
 
 
1444 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.65 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  32.14 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  29.65 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  31.8 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  26.54 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  24.32 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  28.5 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.69 
 
 
326 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  26.57 
 
 
453 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  28.39 
 
 
198 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
255 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  27.5 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  30.68 
 
 
515 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  27.69 
 
 
322 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 
1505 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  27.75 
 
 
1194 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  25.98 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  27.19 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  29.08 
 
 
321 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25.89 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  31.31 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  27.19 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 
451 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  25.81 
 
 
259 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  28.17 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  21.79 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  26.51 
 
 
352 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  27.32 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  24.26 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  24.9 
 
 
244 aa  48.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  27.86 
 
 
558 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  22.82 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  21.36 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 
313 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  25.2 
 
 
276 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  25.09 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  22.22 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  26.83 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  22.93 
 
 
304 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>