72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4583 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  63.94 
 
 
261 aa  275  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  50 
 
 
237 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  44.7 
 
 
241 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  45.78 
 
 
226 aa  189  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  46.49 
 
 
230 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  46.15 
 
 
222 aa  185  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  44.53 
 
 
247 aa  184  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  42.27 
 
 
440 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  38.76 
 
 
240 aa  164  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  40.95 
 
 
455 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  42.62 
 
 
453 aa  158  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  39.38 
 
 
239 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  38.97 
 
 
239 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  39.71 
 
 
452 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  42.78 
 
 
272 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  40.97 
 
 
238 aa  141  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  38.57 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  38.07 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  36.48 
 
 
242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  32.5 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  32.08 
 
 
1145 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  28.97 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  30.14 
 
 
1140 aa  75.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.09 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  30.73 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  28.78 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.27 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  27.91 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  29.65 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  28.77 
 
 
515 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.78 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.8 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  28.27 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  26.15 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  30.08 
 
 
216 aa  62  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  26.81 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  27.83 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  22.92 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  26.21 
 
 
326 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  24.77 
 
 
255 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  27.63 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  29.94 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  30.14 
 
 
352 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
453 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  25.23 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  26.48 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  26.39 
 
 
501 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  28.12 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  28.89 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.37 
 
 
1505 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  28.5 
 
 
215 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  25.77 
 
 
558 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  36.08 
 
 
259 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  26.79 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  27.92 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  26.67 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  27.72 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
1444 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  22.86 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  24.53 
 
 
786 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  29.79 
 
 
451 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  24.63 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  25.85 
 
 
1194 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  33.96 
 
 
258 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  22.34 
 
 
290 aa  45.1  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  22.26 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  23.73 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  26.37 
 
 
260 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>