30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4607 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  44.27 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1630  hypothetical protein  45.12 
 
 
276 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  42.45 
 
 
276 aa  191  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  41.37 
 
 
299 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6435  protein of unknown function DUF1080  37.5 
 
 
280 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  37.3 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  36.5 
 
 
281 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  38.14 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  26.19 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  35.34 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  24.8 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  24.83 
 
 
288 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  26.83 
 
 
291 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  23.4 
 
 
440 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  24.59 
 
 
1444 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  24.04 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  22.86 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  26.72 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  23.27 
 
 
452 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  26.42 
 
 
453 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  25.86 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.86 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  24.19 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  23.53 
 
 
453 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  24.71 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  22.36 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>