24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5719 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 298 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  46.27 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  41.11 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  39.58 
 
 		 291 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  43.18 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  35.85 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  34.47 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  38.6 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  28.9 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  26.55 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  23.66 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  24.21 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  27.23 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  23.65 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  22.49 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  24.9 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  24.18 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6435  protein of unknown function DUF1080  23.91 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  23.6 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  24.2 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  23.57 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  22.11 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  22.14 
 
 		 453 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  22.3 
 
 		 238 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>