66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6569 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
238 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  47.74 
 
 
247 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  43.53 
 
 
440 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  44.25 
 
 
453 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  39.64 
 
 
237 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  39.64 
 
 
455 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  39.06 
 
 
452 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  39.8 
 
 
241 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  41.51 
 
 
234 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  37.3 
 
 
239 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  36.87 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  39.32 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  36.24 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  37.45 
 
 
242 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  34.57 
 
 
239 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  39.81 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  34.6 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  29.83 
 
 
240 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  31.25 
 
 
240 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  31.46 
 
 
1140 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.46 
 
 
451 aa  82.8  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  32.08 
 
 
1145 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  28.36 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  29.58 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.47 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  25.52 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  26.62 
 
 
558 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.72 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  26.19 
 
 
453 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  25.35 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  29.07 
 
 
322 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  26.22 
 
 
193 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  28.93 
 
 
326 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  23.37 
 
 
259 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  24.88 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  27.74 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  24.7 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  26.72 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.89 
 
 
1444 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  25.71 
 
 
247 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  26.75 
 
 
515 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  31.72 
 
 
308 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  25.46 
 
 
258 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  27.23 
 
 
501 aa  48.5  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  27.85 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  28.26 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  26.82 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 
253 aa  45.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  27.43 
 
 
1194 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  27.1 
 
 
259 aa  45.4  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  21.15 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  26.01 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  21.45 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  24.66 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  24.05 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  22.89 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  27 
 
 
482 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  27.19 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  22.97 
 
 
1505 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  27.44 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  22.3 
 
 
298 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  26.7 
 
 
281 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  27.85 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>