33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3358 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  48.66 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  43.58 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  42.78 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  44.03 
 
 		 237 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  37.43 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  35.48 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  40.64 
 
 		 222 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  41.76 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  39.89 
 
 		 226 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  36.95 
 
 		 440 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  36.14 
 
 		 452 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  36.36 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  33.52 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  32.02 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  32.88 
 
 		 455 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  34.17 
 
 		 453 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  28.76 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  29.6 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 		 1145 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  30.18 
 
 		 1140 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.29 
 
 		 451 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.06 
 
 		 1505 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  30.71 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.42 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  26.86 
 
 		 515 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  26.98 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 		 212 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  28.85 
 
 		 451 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  23.89 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>