73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3650 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  53.85 
 
 
237 aa  221  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  51.94 
 
 
261 aa  201  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  48.61 
 
 
234 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  45.27 
 
 
241 aa  177  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  40.24 
 
 
247 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  38.6 
 
 
222 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  37.08 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  38.36 
 
 
242 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  40.69 
 
 
226 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  41.36 
 
 
240 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  34.62 
 
 
239 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  38.94 
 
 
440 aa  141  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  40.09 
 
 
452 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  37.68 
 
 
260 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  37.56 
 
 
453 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  31.62 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  40.88 
 
 
272 aa  131  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  33.19 
 
 
455 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  36.24 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  31.48 
 
 
1140 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  32.55 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 
451 aa  87  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  31.25 
 
 
1145 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  29.6 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  30.54 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  28.63 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  27.88 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.19 
 
 
1505 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.33 
 
 
198 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 
1444 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.78 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  23.5 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  25.81 
 
 
276 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  29.49 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  29.88 
 
 
515 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  27.39 
 
 
197 aa  58.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  23.74 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  28.14 
 
 
322 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  30.95 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  26.06 
 
 
281 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  26.43 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  27.42 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  29.02 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
453 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  25.89 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  26.48 
 
 
451 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  25.81 
 
 
501 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  27.73 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  24.02 
 
 
304 aa  52.4  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  23.74 
 
 
234 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  26.05 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  23 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  26.5 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  23.72 
 
 
313 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  22.66 
 
 
329 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  23.9 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  35.24 
 
 
258 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  24.31 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 
260 aa  45.1  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  26.23 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  29.71 
 
 
884 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  24.2 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  22.61 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  25.75 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  24.74 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  26.74 
 
 
263 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  27.73 
 
 
290 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  22.82 
 
 
308 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  23.73 
 
 
321 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>