61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0438 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  57.58 
 
 
440 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  57.21 
 
 
453 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  50.87 
 
 
452 aa  222  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  51.09 
 
 
455 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  47.74 
 
 
238 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  42.91 
 
 
261 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  47.3 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  42.54 
 
 
237 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  38.34 
 
 
241 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  40.24 
 
 
230 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  37.45 
 
 
222 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  40.94 
 
 
226 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  38.4 
 
 
239 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  36.97 
 
 
260 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  36.07 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  31.45 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  36.65 
 
 
242 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  32.24 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  36.8 
 
 
240 aa  118  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  34.06 
 
 
1140 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  31.6 
 
 
1145 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.89 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  27.45 
 
 
269 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  26.07 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  29.55 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  25.22 
 
 
558 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  27.91 
 
 
216 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.74 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  24.29 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  28.88 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  26.88 
 
 
451 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  25.54 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  27.6 
 
 
209 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  25.34 
 
 
212 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  29.87 
 
 
515 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.83 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  25.21 
 
 
501 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  22.49 
 
 
298 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  25.55 
 
 
453 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.34 
 
 
1444 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  26.42 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  26.75 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  26.91 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  32.14 
 
 
259 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  25.57 
 
 
247 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  23.89 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 
321 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  26.69 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  25.18 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  24.44 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25.31 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  29.88 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 
322 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  25.59 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  27.55 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  20.5 
 
 
288 aa  42.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.22 
 
 
1505 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>