29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0966 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 259 aa  533  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  74.81 
 
 		 258 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  43.43 
 
 		 558 aa  210  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  26.24 
 
 		 451 aa  82  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  27.49 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  30 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 		 515 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  26.24 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  25.52 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  26.34 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  25.42 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 		 440 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  23.33 
 
 		 501 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.31 
 
 		 1140 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  23.97 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  32.14 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  38.1 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  24.22 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  30.23 
 
 		 1145 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  22.91 
 
 		 1505 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  22.31 
 
 		 453 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  23.19 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  32.97 
 
 		 240 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>