63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5725 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  74.48 
 
 
211 aa  300  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  65.52 
 
 
198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  36.27 
 
 
451 aa  115  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  35.41 
 
 
453 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  33.98 
 
 
455 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  34.59 
 
 
515 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  37.1 
 
 
440 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  31.07 
 
 
215 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  34.29 
 
 
452 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  33.19 
 
 
226 aa  97.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  31.16 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  34.76 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  32.82 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  30.94 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  28.17 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  26.61 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.63 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  30.17 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  34.27 
 
 
326 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  26.51 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  28.7 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  28.33 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  27.37 
 
 
453 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  27.54 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  29.56 
 
 
239 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.04 
 
 
261 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.47 
 
 
238 aa  61.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.94 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  27.59 
 
 
1145 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 
558 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  31.13 
 
 
308 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 
451 aa  58.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 
260 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  30.59 
 
 
231 aa  57.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  25.62 
 
 
193 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  28.66 
 
 
241 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  27.36 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.74 
 
 
247 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  27.93 
 
 
1046 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  28.86 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  25.25 
 
 
501 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.57 
 
 
1140 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 
313 aa  49.3  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  28.38 
 
 
321 aa  49.3  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  30.71 
 
 
272 aa  48.5  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  21.93 
 
 
424 aa  48.5  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  30.69 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  24.64 
 
 
242 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  26.13 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.76 
 
 
322 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 
1505 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 
1444 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  25.34 
 
 
884 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  35.37 
 
 
352 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  25.23 
 
 
268 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  28.79 
 
 
281 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  24.54 
 
 
255 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  25.82 
 
 
254 aa  41.2  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>