52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1708 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
451 aa  931    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  34.4 
 
 
440 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  36.17 
 
 
452 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  52.91 
 
 
215 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  33.26 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  33.83 
 
 
455 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  47.87 
 
 
515 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  36.67 
 
 
198 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  36.27 
 
 
198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  29.43 
 
 
453 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  37.29 
 
 
211 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  33.16 
 
 
217 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
218 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  30.23 
 
 
558 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  33.68 
 
 
212 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  26.24 
 
 
259 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  28.25 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  30.5 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.42 
 
 
1145 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  30.73 
 
 
193 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  31.22 
 
 
501 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.63 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  28.36 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  24.65 
 
 
1140 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  26.06 
 
 
216 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  30.96 
 
 
231 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  27.96 
 
 
197 aa  60.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 
1505 aa  60.1  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  28.71 
 
 
326 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  28.79 
 
 
209 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  25.99 
 
 
290 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
237 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.13 
 
 
1444 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.88 
 
 
247 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  26.48 
 
 
230 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  29.5 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  29.17 
 
 
244 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  27.4 
 
 
222 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  26.18 
 
 
308 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 
242 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 
234 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1383  hypothetical protein  26.03 
 
 
218 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  26.2 
 
 
214 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  29.79 
 
 
234 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  25.59 
 
 
226 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
240 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  27.18 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  26.11 
 
 
239 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  25.66 
 
 
1046 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  28.85 
 
 
272 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  24.85 
 
 
239 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>