29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3175 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
258 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  74.81 
 
 
259 aa  411  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  45.42 
 
 
558 aa  212  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  29.01 
 
 
212 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  31.3 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  28.25 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  28.38 
 
 
515 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.6 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.51 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  28.09 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  28.09 
 
 
198 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  27.65 
 
 
455 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  22.57 
 
 
216 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  27.19 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  24.81 
 
 
214 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  21.99 
 
 
501 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
440 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  25.46 
 
 
238 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  24.18 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  35.24 
 
 
230 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  27.18 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  27.55 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  23.58 
 
 
453 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  27.55 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  31.25 
 
 
451 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  27.45 
 
 
447 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  23.98 
 
 
215 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>