62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2881 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
452 aa  931    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  57.68 
 
 
453 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  57.44 
 
 
440 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  53.9 
 
 
455 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  50.87 
 
 
247 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  50.24 
 
 
515 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  36.17 
 
 
451 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  41.28 
 
 
261 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  39.71 
 
 
234 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  39.06 
 
 
238 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  36.84 
 
 
237 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  35.47 
 
 
260 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  39.74 
 
 
222 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  40.09 
 
 
230 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  39.52 
 
 
241 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  36.41 
 
 
226 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  36.32 
 
 
239 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  36.62 
 
 
240 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  36.14 
 
 
272 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  33.63 
 
 
239 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  34.29 
 
 
198 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  35.6 
 
 
217 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  32.5 
 
 
240 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  34.59 
 
 
211 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.13 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
212 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  33.16 
 
 
198 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  31.44 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.63 
 
 
1145 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  24.52 
 
 
1140 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  32.64 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  31.2 
 
 
558 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  31.58 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  25.85 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  27.43 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  26.24 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  28.09 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.17 
 
 
1505 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  29.13 
 
 
244 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
216 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  25.6 
 
 
254 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  27.7 
 
 
326 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  30.06 
 
 
231 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  24.29 
 
 
290 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  23.85 
 
 
259 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  26.51 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 
322 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  24.79 
 
 
287 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  23.27 
 
 
276 aa  46.6  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 
1444 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  27.68 
 
 
212 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  22.71 
 
 
254 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  22.37 
 
 
247 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  26.52 
 
 
501 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  27.45 
 
 
197 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  23.11 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  27.41 
 
 
193 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  26.76 
 
 
209 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  23.53 
 
 
304 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  22.32 
 
 
259 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  22.52 
 
 
276 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>