35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4053 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  27.34 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  31.67 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  31.02 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.61 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  28.19 
 
 		 515 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  26.69 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  26.61 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  31.23 
 
 		 558 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.81 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  30.95 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  28.71 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  28.81 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  29.13 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  28.38 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  27.73 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  28.92 
 
 		 455 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  29.06 
 
 		 440 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  29.17 
 
 		 451 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.72 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  24.9 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27.66 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  26.13 
 
 		 453 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  31.07 
 
 		 1145 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  22.63 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  21.84 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  33.06 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  27.55 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  23.46 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  26.57 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.19 
 
 		 451 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  29.07 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 		 326 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>