51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3234 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 254 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  59.06 
 
 		 268 aa  307  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  54.09 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  52.78 
 
 		 254 aa  271  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  54.3 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  54.66 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  50.59 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  51.83 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  52.49 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  47.22 
 
 		 352 aa  226  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  43.89 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  37.68 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  36.1 
 
 		 540 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  36.23 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  35.87 
 
 		 786 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  31.62 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  32.39 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  31.43 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  29.27 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  28.97 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 		 595 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  27.65 
 
 		 482 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  29.78 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  30.18 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.23 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.47 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  32.6 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  28.77 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  27.49 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  28.36 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  26.75 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.19 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  23.74 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  20.5 
 
 		 1140 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  25.12 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  20.47 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  20.26 
 
 		 1145 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.54 
 
 		 451 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  25.23 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  24.34 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  28.31 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  23.35 
 
 		 453 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 		 455 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  22.71 
 
 		 452 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  24.19 
 
 		 440 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  23.11 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  33.78 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  26.57 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  25.29 
 
 		 579 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>