48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4614 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  62.8 
 
 
255 aa  332  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  54.17 
 
 
254 aa  259  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  55.41 
 
 
247 aa  248  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  51.67 
 
 
254 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  45.93 
 
 
268 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  55.56 
 
 
255 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  47.76 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  50.88 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  46.03 
 
 
257 aa  215  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  45.25 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  36.67 
 
 
540 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  35.58 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  35.45 
 
 
786 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  32.84 
 
 
345 aa  92.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  32.06 
 
 
629 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  32.39 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.16 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  28.9 
 
 
321 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  29.69 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  32.67 
 
 
482 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  29.46 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.96 
 
 
322 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.37 
 
 
1140 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.48 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  28.22 
 
 
478 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  27.44 
 
 
595 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  33.54 
 
 
628 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.19 
 
 
1505 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 
234 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  25.68 
 
 
239 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.98 
 
 
451 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  23.18 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.15 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  26.72 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.4 
 
 
1145 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  27.71 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.13 
 
 
198 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  22.77 
 
 
239 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27.1 
 
 
238 aa  45.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  24 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  25.43 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  22.32 
 
 
452 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  23.41 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  21.97 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  25.1 
 
 
453 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  24.89 
 
 
193 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  25.85 
 
 
272 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>