50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1648 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  47.42 
 
 		 197 aa  187  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  31.52 
 
 		 453 aa  94.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1383  hypothetical protein  32.43 
 
 		 218 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  30.73 
 
 		 451 aa  75.1  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30.86 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  29.65 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  28.3 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  30.46 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  28.72 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.52 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  26.92 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  29.95 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 		 237 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  29.81 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  30.34 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  29.55 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  28.81 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  25.62 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  27.57 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  28.9 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  28.48 
 
 		 440 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  28.79 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  29.02 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  23.91 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.22 
 
 		 238 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  26.9 
 
 		 255 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.32 
 
 		 234 aa  51.2  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  24.3 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  26.52 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  24.06 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  25.13 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  26.25 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  25.12 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27.19 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  25.77 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  27.56 
 
 		 424 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 		 242 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.24 
 
 		 1145 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.75 
 
 		 451 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  23.35 
 
 		 268 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  27.41 
 
 		 452 aa  45.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  38.46 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  25.61 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  23.67 
 
 		 629 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 1444 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.13 
 
 		 1140 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  26.41 
 
 		 260 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>