31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4772 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 628 aa  1283    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  49.58 
 
 		 595 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  39.38 
 
 		 629 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  61.95 
 
 		 482 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  42.63 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  30.42 
 
 		 579 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  30.91 
 
 		 563 aa  187  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  34.66 
 
 		 255 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  31.85 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  34.57 
 
 		 257 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  35.97 
 
 		 268 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  30.57 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  34.29 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  30.86 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  33.33 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  30.06 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  27.49 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  30.77 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  29.38 
 
 		 786 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  31.44 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  27.27 
 
 		 828 aa  60.8  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  30.61 
 
 		 255 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  23.92 
 
 		 969 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  33.54 
 
 		 259 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  29.93 
 
 		 325 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  27.5 
 
 		 308 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  28.69 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  25.82 
 
 		 260 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  25.18 
 
 		 1206 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>