39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3796 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  46.64 
 
 
255 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  53.46 
 
 
352 aa  229  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  51.83 
 
 
254 aa  227  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  55.4 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  50.44 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  50.45 
 
 
255 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  49.32 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  50.94 
 
 
247 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  52.28 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  46.98 
 
 
258 aa  195  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  39.49 
 
 
540 aa  131  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  35.56 
 
 
345 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  40 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  33.18 
 
 
786 aa  85.5  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  34.73 
 
 
629 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  28.36 
 
 
1140 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  33.94 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  31.84 
 
 
482 aa  75.5  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  34.98 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  31.98 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  34.09 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  34.57 
 
 
628 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  32.52 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.06 
 
 
451 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  30.2 
 
 
595 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.52 
 
 
1145 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.65 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.52 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  29.56 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  32.93 
 
 
308 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  25.24 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  24.2 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  27.62 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  24.19 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  25.75 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27.85 
 
 
238 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>