40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3044 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  718    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  59.06 
 
 
255 aa  301  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  49.23 
 
 
255 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  53.46 
 
 
257 aa  229  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  55.09 
 
 
247 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  51.35 
 
 
254 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  47.73 
 
 
254 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  50.66 
 
 
259 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  50.22 
 
 
268 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  46.34 
 
 
281 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  44.55 
 
 
258 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  37.34 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  41.21 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  35.68 
 
 
325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  35.78 
 
 
786 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  34.64 
 
 
482 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  33.85 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  37.41 
 
 
629 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  31.38 
 
 
595 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.75 
 
 
1140 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  34.72 
 
 
478 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  29.86 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  30.65 
 
 
260 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  31.48 
 
 
261 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  29.92 
 
 
241 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  34.15 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  31.44 
 
 
628 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  23.37 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.4 
 
 
1145 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  27.67 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  30.14 
 
 
234 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  32.37 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  25.99 
 
 
240 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.51 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.6 
 
 
237 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  26.03 
 
 
239 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  23.81 
 
 
240 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  35.37 
 
 
198 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  35.14 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  24.66 
 
 
238 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>