64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5384 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 322 aa  658    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  60.35 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  47.45 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  42.58 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  39.26 
 
 		 629 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  33.74 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  33.13 
 
 		 595 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  32.72 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  32.14 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  35.06 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  34.19 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  31.46 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  37.35 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  29.26 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  30.77 
 
 		 1145 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 		 628 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.96 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  34.09 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  29.78 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  30.73 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  28.09 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  31.34 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  30.04 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  32.62 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  28.36 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.59 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  29.73 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  26.52 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  25.58 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  31.35 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  27.93 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  28.14 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.6 
 
 		 1140 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  26.51 
 
 		 786 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  27.6 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  27.69 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  26.7 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.38 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 258 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  27.34 
 
 		 198 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  29.07 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.38 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  26.44 
 
 		 1194 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  26.57 
 
 		 579 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  24.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  27.41 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  25.57 
 
 		 240 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  28.39 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  26.42 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 		 452 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.76 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  26.76 
 
 		 211 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  28.29 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  24.31 
 
 		 216 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  27.18 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  23.56 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  24.32 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  26.6 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  23.26 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.14 
 
 		 1505 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 453 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  25.29 
 
 		 1046 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>