33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2206 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
478 aa  974    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  52.44 
 
 
482 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  42.63 
 
 
628 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  51.39 
 
 
595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  51.61 
 
 
629 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  33.33 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  33.68 
 
 
579 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  32.72 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  30.52 
 
 
321 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  35.86 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  30.86 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  31.98 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  30.2 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  30.05 
 
 
540 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  30.85 
 
 
281 aa  67  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  34.72 
 
 
352 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  36.36 
 
 
247 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  32.89 
 
 
255 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  30.34 
 
 
258 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  34.97 
 
 
345 aa  63.9  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  28.36 
 
 
254 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  32.35 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  28.96 
 
 
786 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  29.28 
 
 
254 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  35.66 
 
 
325 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  28.22 
 
 
259 aa  57  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  30.65 
 
 
969 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  30.16 
 
 
358 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  25.93 
 
 
308 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  26.15 
 
 
260 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  29.05 
 
 
263 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  27.93 
 
 
515 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  22.6 
 
 
1145 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>