48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1623 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  59.06 
 
 		 352 aa  301  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  57.8 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  46.64 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  55.56 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  52.49 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  53.52 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  50.22 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  52.53 
 
 		 281 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  47 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  47.83 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  43.07 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  39.51 
 
 		 540 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  36.73 
 
 		 325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  38.97 
 
 		 786 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  36.21 
 
 		 629 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  33.49 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  34.35 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  35.98 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  31.46 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  31.67 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  34.66 
 
 		 628 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  31.55 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  30.2 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  34.25 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  23.68 
 
 		 1140 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  31.66 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  23.5 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  24.77 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  25.35 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.1 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 1145 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  22.45 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  31.92 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.78 
 
 		 1505 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  24.31 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  23.46 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  24.31 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  23.77 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  22.67 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  24.12 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  23.56 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  23.89 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.99 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  26.17 
 
 		 501 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>