69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3462 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
261 aa  537  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  63.94 
 
 
234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  52.34 
 
 
237 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  51.94 
 
 
230 aa  201  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  46.34 
 
 
241 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  47.87 
 
 
226 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  42.91 
 
 
247 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  45.45 
 
 
440 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  40.23 
 
 
260 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  40.77 
 
 
239 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  37.19 
 
 
240 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  38.62 
 
 
239 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  44.12 
 
 
222 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  43.03 
 
 
453 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  41.28 
 
 
452 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  41.31 
 
 
455 aa  158  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  43.58 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  37.25 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  37.33 
 
 
240 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  34.6 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  31.13 
 
 
451 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  31.58 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 
1145 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  28.23 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.94 
 
 
1505 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  26.36 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  29.82 
 
 
1140 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  30.58 
 
 
515 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  28.26 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  30.64 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.94 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  31.48 
 
 
352 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  26.69 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  27.7 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  29.22 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  26.19 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  29.68 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  29.55 
 
 
501 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.04 
 
 
198 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  31.43 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  27.11 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.99 
 
 
211 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  27.8 
 
 
453 aa  58.9  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  28.35 
 
 
216 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.75 
 
 
1444 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  25.22 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  27.37 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  27.65 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  27.32 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  29.3 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  24.54 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
209 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  28.38 
 
 
322 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  25.1 
 
 
558 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  22.45 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  26.52 
 
 
193 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  29.19 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  27.86 
 
 
197 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  25.13 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  24.9 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 
451 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  27.75 
 
 
217 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  25.82 
 
 
786 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.4 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  24.51 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  26.11 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>