21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1169 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  30 
 
 		 313 aa  86.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  30.82 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  29.79 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  26.54 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25.97 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  27.23 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.37 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  26.83 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  25.24 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  25.5 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  26.25 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  24.12 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.42 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  22.53 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  24.31 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  22.94 
 
 		 290 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  24.37 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  23.89 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>