56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1130 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  44.39 
 
 
260 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  37.93 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  37.19 
 
 
261 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  39.45 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  38.76 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  31.62 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  28.03 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  33.64 
 
 
237 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  33.05 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  31.45 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  34.42 
 
 
242 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  36.62 
 
 
452 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  29.83 
 
 
238 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  33.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  31.36 
 
 
440 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  31.94 
 
 
240 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  31.73 
 
 
455 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
453 aa  98.6  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  25.22 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.73 
 
 
1140 aa  79  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.23 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 
1145 aa  72.8  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.73 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  23.55 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  30.32 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  25.47 
 
 
209 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  28.05 
 
 
501 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  31.35 
 
 
322 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  28.71 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  27.63 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  29.78 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.11 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.27 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  22.9 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  29.54 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  24.77 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  23.45 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  23.46 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  27.84 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  24.88 
 
 
453 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  23.14 
 
 
1444 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  28.48 
 
 
326 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  22.18 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
451 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.4 
 
 
1505 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30.26 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  25.36 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  23.53 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  25.61 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  27.71 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  24.75 
 
 
281 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  23.89 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>