24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2283 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
313 aa  636    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  30.63 
 
 
224 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  29.9 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  27.08 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  27.1 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  27.11 
 
 
229 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  26.13 
 
 
249 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  31.11 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.19 
 
 
1145 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  23.91 
 
 
193 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  26.84 
 
 
290 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 
198 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  23.72 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  23.46 
 
 
237 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  26.51 
 
 
451 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  27.78 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  26.99 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  24.62 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  21.21 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  27.71 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  22.3 
 
 
1140 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  22.96 
 
 
197 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  23.21 
 
 
239 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  23.2 
 
 
269 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>