46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1112 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  47.42 
 
 		 193 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  36.02 
 
 		 453 aa  95.5  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1383  hypothetical protein  28.28 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  28.95 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  30.45 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  30.17 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  27.72 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  30.43 
 
 		 455 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  28.81 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  28.72 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  30.6 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  25.58 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.5 
 
 		 451 aa  61.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  27.96 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  30.11 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  27.1 
 
 		 453 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  27.39 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  28.42 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  24.76 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  28.25 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.95 
 
 		 1444 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25.66 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.25 
 
 		 1140 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  27.39 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.86 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  26.16 
 
 		 440 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  24.23 
 
 		 1194 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.26 
 
 		 1145 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  21.66 
 
 		 239 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  28.77 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.12 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  21.36 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  25.53 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  28.48 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.23 
 
 		 1505 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  27.45 
 
 		 452 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  23.93 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  20.8 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  23.41 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  23.31 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  24.79 
 
 		 242 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>