36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0295 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  54.84 
 
 
217 aa  215  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  41.62 
 
 
218 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  31.16 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  29.01 
 
 
258 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
452 aa  85.9  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  30.81 
 
 
558 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  33.68 
 
 
451 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  31.94 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  31.77 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  34.04 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  28.29 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  29.41 
 
 
453 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  31.12 
 
 
455 aa  75.5  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  29.96 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  30.64 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  26.56 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  28.12 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  25.12 
 
 
260 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  27.73 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  27.42 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  22.9 
 
 
240 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  31.68 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.81 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  22.8 
 
 
453 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.45 
 
 
1505 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  24.3 
 
 
1140 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  24.04 
 
 
501 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  25.53 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
451 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>