51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2202 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
453 aa  926    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  65.91 
 
 
440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  60.31 
 
 
455 aa  551  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  57.68 
 
 
452 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  57.21 
 
 
247 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  46.32 
 
 
515 aa  239  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  33.26 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  41.78 
 
 
237 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  43.03 
 
 
261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  44.86 
 
 
234 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  40.27 
 
 
222 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  44.25 
 
 
238 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  37.56 
 
 
230 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  37.39 
 
 
239 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  35.48 
 
 
241 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  38.25 
 
 
226 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  36.28 
 
 
239 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  35.24 
 
 
260 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  35.41 
 
 
198 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.92 
 
 
1145 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  32.89 
 
 
217 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  34.17 
 
 
272 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  34.95 
 
 
198 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  35.48 
 
 
211 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
240 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  35.86 
 
 
242 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 
1140 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  34.67 
 
 
240 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  31.79 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  29.41 
 
 
212 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  22.95 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 
234 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  28.72 
 
 
193 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  28.97 
 
 
558 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  27.1 
 
 
197 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  29.36 
 
 
268 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.32 
 
 
1444 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  33.77 
 
 
326 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  25.79 
 
 
501 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  27.12 
 
 
290 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  28.82 
 
 
231 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  24.32 
 
 
216 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  23.35 
 
 
254 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  26.13 
 
 
244 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  27.63 
 
 
308 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  23.43 
 
 
276 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  23.68 
 
 
229 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>