49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1206 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
229 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  29.27 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  25.78 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  26.79 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  29.21 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  23.66 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  27.11 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  26.56 
 
 
304 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27.54 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  23.69 
 
 
288 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  26.81 
 
 
276 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  22.37 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  25.95 
 
 
329 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  26.07 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  25.22 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  32.67 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  24.6 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  23.29 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  23.76 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  25.2 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  22.98 
 
 
291 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  24.72 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  23.45 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  29.17 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  27.54 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 
198 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1630  hypothetical protein  29.51 
 
 
276 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
198 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
1145 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.94 
 
 
1444 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  22.55 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  23.9 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  21.33 
 
 
451 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  30 
 
 
311 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  22.27 
 
 
287 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  28.46 
 
 
299 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  24.44 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6435  protein of unknown function DUF1080  26.95 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  26.02 
 
 
455 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  24.05 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  22.22 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  23.68 
 
 
453 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  24.14 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  25.23 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  34.72 
 
 
326 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  36.51 
 
 
308 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>