14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0775 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  672    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  48.77 
 
 
290 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  34.9 
 
 
288 aa  159  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  38.6 
 
 
298 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  34.2 
 
 
291 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  28.23 
 
 
304 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  30.8 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  33.21 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  27.64 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  25.95 
 
 
229 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  25.24 
 
 
224 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  26.17 
 
 
276 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.45 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  22.66 
 
 
230 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>