25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3043 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  559  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  63.64 
 
 		 304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  46.27 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  34.66 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  35.92 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  40.19 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  33.21 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  31.23 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  27.34 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  26.87 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  27.45 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  24.54 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  26.43 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  23.85 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  21.79 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  24.46 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  23.11 
 
 		 452 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  21.15 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  23.53 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.45 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  24.61 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  23.2 
 
 		 313 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>