26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1851 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  63.64 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  43.18 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  39.54 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  33.21 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  34.48 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  29.47 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  31.17 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  26.59 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.67 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  26.56 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  23 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  22.58 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.54 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  24.02 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  22.08 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  22.38 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.31 
 
 		 1145 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  24.12 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  22.52 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  23.53 
 
 		 452 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25.2 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  25.75 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  25.27 
 
 		 226 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  24.24 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  22.81 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>