22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3672 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6435  protein of unknown function DUF1080  56.7 
 
 
280 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  53.73 
 
 
287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  53.1 
 
 
281 aa  278  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  48.68 
 
 
299 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  48.06 
 
 
311 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1630  hypothetical protein  47.95 
 
 
276 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  43.75 
 
 
259 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  42.45 
 
 
276 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  28.85 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  26.81 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  32.79 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  24.54 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  26.77 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  22.38 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  24.69 
 
 
326 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  23.33 
 
 
288 aa  45.4  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  24.15 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  22.52 
 
 
452 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  23.73 
 
 
234 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  22.57 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  25.71 
 
 
214 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>