16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3533 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  48.77 
 
 
329 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  33.99 
 
 
298 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  37.79 
 
 
288 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  34.7 
 
 
291 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  36.4 
 
 
304 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  31.17 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  31.23 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  30.53 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  23.78 
 
 
229 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  22.81 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  22.18 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  23.36 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  22.94 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>