17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4135 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 291 aa  613  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  39.58 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  37.37 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  35.92 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  34.7 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  39.54 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  37.06 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  34.2 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  32.5 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  28.39 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  26.7 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  22.98 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  26.5 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  26.83 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  22.01 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  21.24 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  22.57 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>