22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3573 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  587  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  28.83 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  30.22 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  32.5 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  30.19 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  29.57 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  27.99 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  27.53 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  26.77 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  26.74 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  23.43 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6435  protein of unknown function DUF1080  27.14 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1630  hypothetical protein  34.56 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  35.56 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  31.72 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  24.15 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  26.19 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  21.72 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  25.95 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  25.5 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  22.56 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  23.57 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>