18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1630 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1630  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  47.31 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6435  protein of unknown function DUF1080  44.44 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  42.97 
 
 		 281 aa  214  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  45.12 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  43.75 
 
 		 287 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  41.47 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  39.92 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  39.85 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  34.65 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  29.51 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.22 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25.62 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  24.75 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  24.14 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  27.53 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  21.53 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>