54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3499 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
234 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  63.44 
 
 
234 aa  248  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  39.7 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  29.27 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  28.19 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  29.36 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  26.98 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  27.43 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  28.78 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  25.97 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  23.55 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.7 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  28.82 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  24.57 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.7 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  31 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 
453 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  23.98 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
241 aa  58.5  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  24.54 
 
 
269 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.71 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 
1145 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  23.41 
 
 
451 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.5 
 
 
1505 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  23.77 
 
 
515 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  25.89 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  27.54 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 
326 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  23.74 
 
 
230 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.99 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  25.66 
 
 
197 aa  52  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  28.44 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  23.86 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  24.29 
 
 
453 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  22.34 
 
 
253 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 
451 aa  48.5  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  22.08 
 
 
1046 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.12 
 
 
1444 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  23.26 
 
 
242 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  28.16 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  22.65 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.62 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.31 
 
 
247 aa  45.1  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  29.29 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  20.98 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  35.14 
 
 
352 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  25.2 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  22.89 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  23.11 
 
 
1140 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  33.78 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  23.89 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1630  hypothetical protein  24.26 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.47 
 
 
231 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>