18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1607 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  63.44 
 
 
234 aa  248  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  43.37 
 
 
249 aa  148  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  27.08 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  26.54 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  29.21 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  28.65 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  24.72 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  27.32 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  27.85 
 
 
1046 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  26.9 
 
 
440 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.15 
 
 
237 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.57 
 
 
451 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  24.62 
 
 
239 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  24.62 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  26.11 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  24.61 
 
 
269 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 
455 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>