51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5676 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
455 aa  931    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  60.31 
 
 
453 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  58.14 
 
 
440 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  53.9 
 
 
452 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  48.89 
 
 
515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  51.09 
 
 
247 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  33.83 
 
 
451 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  41.74 
 
 
234 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  41.31 
 
 
261 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  39.64 
 
 
238 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  35.56 
 
 
237 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  37.84 
 
 
222 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  33.19 
 
 
230 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  34.58 
 
 
241 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  32.2 
 
 
260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  37.04 
 
 
226 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  33.63 
 
 
239 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.29 
 
 
451 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  33.98 
 
 
198 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  30.8 
 
 
239 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  32.88 
 
 
272 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  31.73 
 
 
240 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  30.67 
 
 
240 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.92 
 
 
1140 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
1145 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  32.61 
 
 
198 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  34.95 
 
 
211 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  29.33 
 
 
242 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  32.78 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  35.6 
 
 
218 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  28.19 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  31.12 
 
 
212 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  31.54 
 
 
558 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  31.36 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  30.43 
 
 
197 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  31.55 
 
 
215 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  30.46 
 
 
193 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  29.21 
 
 
453 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  27.65 
 
 
258 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  25.42 
 
 
259 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  32.43 
 
 
326 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  23.71 
 
 
290 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  28.92 
 
 
244 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  27.39 
 
 
268 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30.82 
 
 
308 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  29.22 
 
 
209 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 
254 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.53 
 
 
212 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  30 
 
 
214 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  26.02 
 
 
229 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.08 
 
 
1505 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>