More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  46.21 
 
 		 1143 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  45.3 
 
 		 1135 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  53.21 
 
 		 945 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.67 
 
 		 953 aa  808    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  44.04 
 
 		 1142 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  44.9 
 
 		 1151 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  43.4 
 
 		 1138 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  53.14 
 
 		 1200 aa  1031    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 1505 aa  3046    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  44.13 
 
 		 1182 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  57.66 
 
 		 1444 aa  1112    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 800 aa  532  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  43.23 
 
 		 941 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  41.12 
 
 		 918 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  37.65 
 
 		 908 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  35.27 
 
 		 1194 aa  430  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  38.96 
 
 		 909 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  39.33 
 
 		 918 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  38.1 
 
 		 984 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  68.26 
 
 		 392 aa  316  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 232 aa  292  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 245 aa  261  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.65 
 
 		 272 aa  257  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  54.84 
 
 		 276 aa  232  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  49.57 
 
 		 247 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  44.49 
 
 		 275 aa  218  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  44.31 
 
 		 260 aa  215  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  47.27 
 
 		 279 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  46.67 
 
 		 255 aa  213  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  48.6 
 
 		 895 aa  200  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  42.74 
 
 		 375 aa  185  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  30.91 
 
 		 1029 aa  184  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.46 
 
 		 841 aa  169  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  27.26 
 
 		 1081 aa  156  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  40.09 
 
 		 285 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 892 aa  151  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 277 aa  150  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  35.48 
 
 		 346 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.7 
 
 		 1657 aa  141  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  35.09 
 
 		 292 aa  132  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  26.56 
 
 		 712 aa  129  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  31.22 
 
 		 266 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  31.39 
 
 		 258 aa  120  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  36.98 
 
 		 212 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  31.18 
 
 		 296 aa  112  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  32.87 
 
 		 255 aa  112  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.16 
 
 		 601 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  28.81 
 
 		 387 aa  107  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  27.11 
 
 		 999 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  27.11 
 
 		 999 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  27.06 
 
 		 999 aa  103  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  26.16 
 
 		 1132 aa  100  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  32.18 
 
 		 394 aa  99.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 		 369 aa  98.2  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.93 
 
 		 442 aa  96.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  27.03 
 
 		 366 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  27.55 
 
 		 422 aa  93.2  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.65 
 
 		 413 aa  92.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.49 
 
 		 396 aa  92.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  33.66 
 
 		 231 aa  92  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  31.27 
 
 		 374 aa  90.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.27 
 
 		 374 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.16 
 
 		 360 aa  90.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  31.29 
 
 		 2172 aa  89.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  32.72 
 
 		 408 aa  89  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  28.96 
 
 		 377 aa  89  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 407 aa  89  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  29.47 
 
 		 471 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  27.76 
 
 		 392 aa  87  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 		 415 aa  87.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  30.57 
 
 		 375 aa  87.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  47.92 
 
 		 1121 aa  87.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 		 386 aa  87  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  31.1 
 
 		 371 aa  86.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  30.51 
 
 		 241 aa  86.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  27.74 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  25.46 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  30.6 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  23.11 
 
 		 972 aa  84.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  29.49 
 
 		 369 aa  84  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  32.91 
 
 		 894 aa  84  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  27.46 
 
 		 430 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  28.72 
 
 		 387 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.84 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.42 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.53 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  27.57 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  25.62 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  29.17 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  36.17 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  29.04 
 
 		 387 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  27.1 
 
 		 395 aa  81.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  27.54 
 
 		 399 aa  80.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 		 482 aa  80.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  26.52 
 
 		 306 aa  79.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  27.81 
 
 		 268 aa  79.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.96 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  25.96 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.19 
 
 		 385 aa  78.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>