62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2871 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
326 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  60.35 
 
 
322 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  54.55 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  47.54 
 
 
308 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  33.49 
 
 
255 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  33 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  32.39 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  30.38 
 
 
1145 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  33.74 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  33.85 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  32.4 
 
 
629 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  30.86 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  31.79 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  32.29 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  31.41 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  35.53 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  34.98 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  29.41 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  29.77 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  30.57 
 
 
628 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  30.54 
 
 
595 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  34.27 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  31.96 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  29.06 
 
 
1140 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  32.14 
 
 
198 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  31.94 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  31.61 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  31.16 
 
 
259 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  30.53 
 
 
231 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  28.81 
 
 
197 aa  63.5  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  31.69 
 
 
222 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  28.49 
 
 
453 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  26.92 
 
 
193 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  28.83 
 
 
226 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.21 
 
 
234 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  28.71 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  23.91 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  29.38 
 
 
786 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  32.43 
 
 
455 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  30.56 
 
 
211 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  33.77 
 
 
453 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  32.05 
 
 
540 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 
234 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  25.52 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  24.75 
 
 
447 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  27.7 
 
 
452 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  28.93 
 
 
238 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
214 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  26.99 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  33.82 
 
 
215 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  26.26 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  31.29 
 
 
440 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.42 
 
 
247 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  24.53 
 
 
241 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  24.69 
 
 
276 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  28.48 
 
 
240 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  33.77 
 
 
515 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  22.27 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  31.4 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.62 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  23.91 
 
 
216 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>