45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2684 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  530  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  63.67 
 
 		 281 aa  340  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  63.3 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  57.27 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  46.67 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  52.14 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  47.88 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  53.52 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  55.4 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  47.73 
 
 		 352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  45.97 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  37.75 
 
 		 540 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  37.74 
 
 		 786 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  33.75 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  32.32 
 
 		 325 aa  99.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  34.52 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  28.78 
 
 		 629 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  31.03 
 
 		 482 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  32.29 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  31.18 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  31.34 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  31.47 
 
 		 595 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  24.15 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.54 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  30.77 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  29.68 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.22 
 
 		 451 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.15 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  29.28 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  29.81 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.44 
 
 		 1140 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  27.78 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.63 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  25.55 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  25.6 
 
 		 452 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  23 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  24.77 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  23.79 
 
 		 1145 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.18 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  20.91 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27.19 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  26.32 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  28.87 
 
 		 453 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>