44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1044 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  58.85 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  57.02 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  52.57 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  53.26 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  55.41 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  58.6 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  48 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  55.09 
 
 		 352 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  47.31 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  50.94 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  34.86 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  37.19 
 
 		 540 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  35.85 
 
 		 786 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  32.02 
 
 		 629 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  33.14 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  36.17 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.41 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  29.18 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.91 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  27.23 
 
 		 1140 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  31.28 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  37.06 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  27.75 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  30.06 
 
 		 628 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 		 595 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  29.22 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  28.24 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  29.09 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 		 1145 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  26.18 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.64 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  26.94 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  24.8 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.57 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  28.7 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  22.94 
 
 		 451 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  22.37 
 
 		 452 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  20.9 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  24.23 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  21.78 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>