43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1017 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 786 aa  1622    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1754  hypothetical protein  36.17 
 
 		 386 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  36.99 
 
 		 675 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3960  hypothetical protein  35.62 
 
 		 405 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698754  normal  0.0204382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  36.32 
 
 		 345 aa  133  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  30.03 
 
 		 739 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  29.46 
 
 		 739 aa  127  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  38.97 
 
 		 255 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1066 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  26.89 
 
 		 767 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  35.32 
 
 		 352 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  35.87 
 
 		 254 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  30.47 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  37.74 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  35.85 
 
 		 247 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  31.62 
 
 		 325 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  27.82 
 
 		 718 aa  108  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  34.96 
 
 		 268 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  34.82 
 
 		 255 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  27.25 
 
 		 757 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3946  hypothetical protein  28.15 
 
 		 555 aa  101  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  35.45 
 
 		 259 aa  101  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  25.38 
 
 		 741 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  25.38 
 
 		 741 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  25.06 
 
 		 741 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  33.02 
 
 		 281 aa  98.2  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.27 
 
 		 834 aa  97.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2760  hypothetical protein  31.91 
 
 		 385 aa  90.9  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.120597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  33.8 
 
 		 258 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  33.18 
 
 		 257 aa  85.9  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07279  GPI anchored protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01300)  27.27 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  35.9 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  32.72 
 
 		 595 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  33.19 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  30.86 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  30.17 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  29.38 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  29.28 
 
 		 478 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  27.5 
 
 		 308 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  29.38 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  26.94 
 
 		 321 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  24.53 
 
 		 234 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>