36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6272 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 482 aa  991    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  52.44 
 
 		 478 aa  488  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  61.95 
 
 		 628 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  57.71 
 
 		 595 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  54.55 
 
 		 629 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  33.18 
 
 		 563 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  37.21 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  36.72 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  34.64 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  37.95 
 
 		 345 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  33.74 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  35.98 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  31.89 
 
 		 321 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  33.74 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  38.24 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  31.84 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  31.03 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  32.76 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  36.17 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  35.57 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  35.9 
 
 		 786 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  27.65 
 
 		 254 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  31.55 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  36.69 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  28.72 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  27.94 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  29.27 
 
 		 308 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  22.82 
 
 		 828 aa  50.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  25.41 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  28.71 
 
 		 969 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  26.54 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  29.1 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  23.29 
 
 		 1145 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27 
 
 		 238 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  26.81 
 
 		 260 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>